据BBC中文网报道，台湾的五个直辖市表示将与教育部「不同步」，拒绝采用经过教育部「微调」过的历史教材。
　　台湾的媒体报道说，在出席民间组织—台湾教授协会对此所举办的座谈会时、代表台北、桃园、台中、台南以及高雄出席的市政府教育官员均表示反对教育部「微调」之后的高中新课纲。
　　导致五个直辖市反对的原因据称是新的高中历史课本中，去除了发生在1947年的「二二八事件」以及国民党政府撤退到台湾之后所实施的「白色恐怖」。
　　表示反对的五个直辖市除了台北市是由无党籍的柯文哲执政，其余四个直辖市市长都是民进党籍。
　　与会的直辖市官员说，之前台湾教育部「微调」课纲就是「黑箱作业」，二二八和白色恐怖都是「台湾的重要历史事实」不应该删除。
　　有台湾的历史学者抨击马英九政府，指责教育部的「微调」就是「要掩盖当年残暴统治的历史」。
　　但教育部说，有关二二八和白色恐怖的历史，学校可以「补充教学」，但是强调「微调」合宪、合法、合程序、将会按时在今年8月新学期「如期实施」。