3月31日晚，7个台湾青年团体连夜赶到总统府门口的凯达格兰大道抗议，称马英九政府「黑箱」操作，他们还提出了「拒绝『主权』矮化」、「提出实质评估」、「程序公开透明，凝聚社会共识」、「民意基础不足，停止政经整并」等诉求。
　　这些声音已不新鲜。31日一早，3名台联党立委便占领了立法院议场主席台，阻挠议事。他们抗议马政府「黑箱作业」申请加入亚投行。
　　在台北抗议现场，黑色岛国青年阵线等7社运团体号召群众，31日晚间9时许前往凯道抗议，学运代表王奕凯指出，发动突袭总统府抗议行动，约30人遭宪兵及维安人员拦阻，其中吴峥、王奕凯等4人遭逮捕。警方不断劝离，群众高喊「警察后退」，双方爆发激烈冲突，还有民众遭抬离现场。
　　台湾黑色岛国青年阵线、民主斗阵、台左维新、梦由艺文工作室、独台新社、台大法言等6个团体发出联合声明，开篇即表示「我们反对台湾政府以极为草率的方式决定加入亚投行」，理由共五点：1、反对台湾盲目追随经济强权的金融资本主义竞赛;2、大陆借亚投行的各国资金来增加权力;3、对环境、劳工人权的坚持;4、黑箱过程、一人决策、赔上全「国」;5、意向同意书未照应有程序、矮化「主权」。
　　3月31日是亚投行创始成员国申请的截止日期，当天，台湾方面通过大陆国台办递交「意向书」，希望成为亚投行创始成员。