2013年2月，中国香港特区政府化验所发现，云南白药样本中含有未标示的毒性物质乌头类生物硷，此后香港特区卫生署和澳门特区卫生局发出停用回收通知。
　　据此，有媒体质疑云南白药的安全性。随后，媒体又曝出“云南白药悄然修改药品说明书”。
　　云南白药集团称，截至今年3月，云南白药集团胶囊剂、气雾剂、片剂、颗粒剂、小容量注射剂(非最终灭菌)、橡胶膏剂等15个剂型全部通过国家新版药品GMP认证。
　　云南白药集团4月4日回应称，修改相关药品说明书是根据食品药品监管总局通知要求而为，其药品配方中所含草乌(制)在加工过程中，已使乌头硷类物质的毒性得以消解或减弱，产品安全有效。