穆尔西在5月举行的首轮总统选举投票中赢得24.4%的选票，在12名候选人中位居第一。
在结果宣布後，穆斯林兄弟会竞选团队在自由与正义党总部召开新闻发布会，高呼“革命者和自由的人民，我们将继续前进”等口号，呼吁所有埃及人和他们一起建设一个美好的新埃及。得知穆尔西当选後，武装部队最高委员会主席坦塔维和临时政府总理詹祖里通过国家电视台向他表示祝贺。
当地时间24日晚间，穆尔西发表了当选後的首次电视讲话。在这段时长约30分钟的讲话中，穆尔西呼吁所有埃及民众消除分歧，实现社会团结。他说，埃及社会目前正面临严重分裂，所有民众应冰释前嫌，团结一致，实现社会和解。同时他表示，“我们将努力保护埃及的安全。我们尊重所有的国际条约和协议。我们已经告诉世界，我们想要和平。”
去年2月11日，埃及前总统穆巴拉克因大规模反政府示威活动辞职，武装部队最高委员会接管国家权力。历经一场变革、两轮选举、数月动荡、万人示威的埃及时隔31年，终於迎来新总统。埃及官方《金字塔报》称，穆尔西赢得了埃及史上首次“真正意义的”、“有多个竞选人”的大选。穆尔西成为埃及首位代表伊斯兰运动的总统，同时也是首位没有军方背景的总统，终结了长达60年的军人专权。
穆尔西不愿放过穆巴拉克
穆罕默德·穆尔西现年60岁，曾获得开罗大学工程学学士和硕士学位，1982年获美国南加利福尼亚大学工程学博士学位。1982年至1985年，穆尔西在加利福尼亚州州立大学北岭分校任助教，1985年至2010年任埃及东部省宰加济格大学工程系主任。
潜心做学问的同时，穆尔西没有停止进军政坛的脚步。他先前多次当选埃及人民议会议员，2005年成为穆斯林兄弟会最高决策机构指导局的成员。2011年4月底，他从穆兄会指导局辞职，组建自由与正义党并出任党主席。
支持者称穆尔西与穆巴拉克政权做斗争的经历和担任议员期间的出色政绩，是他最大的筹码。他详细的经济计划也将最大程度地致力於将埃及建设成发达国家。但反对者则担心他当选後会成为穆斯林兄弟会的傀儡。
穆尔西曾表示，他出任总统後将不会受6月2日穆巴拉克案判决结果制约，因为主审法官全部“由旧体制委任”。“出任总统将赋予我重新审视这一案件及其判决的机会，我保证当选後，那些杀害示威者的人将受到重新审理。”他还承诺确保穆巴拉克所受贪腐、选举舞弊和其他罪名成立，“不可能让他获释”。
穆尔西政见
政治：穆尔西曾号召对2000年火车撞车事件、上届政府枪杀反对派的行为进行调查，但其行动却不尽如人意。
经济：穆尔西复兴计划对埃及面临的问题给出了全面的解决方案，包括街道垃圾管理。他倡导建立自由市场经济，吸引外资以扭转经济下滑。私有化方案可能会被重提。
外交：穆尔西反对以色列的占领行为，这也可能导致埃及对美国和以色列外交政策的转变。不过，穆尔西的孩子都有美国国籍。
法律：自由与正义党如果“占领”国会和总统位置，它将事实上成为对国家事务负责的唯一政党，其他政党估计也不能弹劾，宪法可能会按穆斯林的意志重新起草，从而只能代表部分人的利益。其所持的反女权主义者的观点可能也会被写进去。
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