美国海军属於国防部海军部管辖，由一个文人担任美国海军部长(SECNAV)为实质指挥官。资深海军武官将领最高位阶可以当到海军作战部长(CNO)，并且立即拥有四星上将的官阶。同时也自动成为参谋首长联席会成员和美国国安会第二号人物，虽然这些名义上只是总统谘询机构但其实握有实权。海军秘书长和执行长可以调动组织、管理招募、规定训练和装备海军以备随时接收区域联合作战司令部的指挥。
　　海军共有九大部门：大西洋舰队、太平洋舰队、中央指挥部、欧洲舰队、网路战争指挥部、海军预备队、特种作战部、研考部和补给司令部。舰队在海军中定位成武力提供者;他们不能自己拟定作战计画，只能维护和训练战斗单元以备随时供应区域联合作战司令部派遣。非公开的美国海域外军舰行动都被定为成特遣队，通常由第二第三舰队执行。只要进入其他编号舰队负责的区域，特遣队就会重新编号。例如一个航母战斗群进入地中海西岸就会被命名为特遣队20.1;进入地中海内就变成特遣队60.1。
　　海军共有七支舰队—第二、第三、第四、第五、第六、第七，和第十舰队，都由三星中将指挥，除了第四舰队由两星少将指挥。其他六支舰队由区域司令部指挥分成大西洋舰队、太平洋舰队、欧洲舰队、中央指挥部(只指挥第四舰队，等於第四舰队有两层重复指挥)等任务编组;这四位任务性指挥官全是四星上将。
　　美国海军现有核子动力航母共11艘，核潜艇、驱逐舰等各类一级作战舰艇200余艘。整体作战实力雄踞世界第一。